TriLink提供了一個3'iCLIP底漆，用于iCLIP應(yīng)用程序。紫外線交聯(lián)免疫沉淀（CLIP）是一種闡明RNA與蛋白質(zhì)相互作用的強(qiáng)大技術(shù)。標(biāo)準(zhǔn)協(xié)議通常采用標(biāo)記的銜接子來可視化蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。該方法涉及RNA與蛋白質(zhì)的不可逆交聯(lián)，免疫沉淀，5'和3'銜接子的連接，逆轉(zhuǎn)錄，后是PCR擴(kuò)增。不幸的是，逆轉(zhuǎn)錄酶無法讀取交聯(lián)區(qū)域，這會產(chǎn)生截短的cDNA，而沒有啟動PCR擴(kuò)增所需的3'和5'銜接子。
CLIP方法的一種變化，單個核苷酸分辨率的UV交聯(lián)和免疫沉淀（iCLIP）通過使用預(yù)腺苷酸化引物（iCLIP引物）和逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的環(huán)化來解決此問題。該方法也將結(jié)合位點解析為各個核苷酸，并提高了位于重復(fù)基序內(nèi)的結(jié)合位點的準(zhǔn)確性。
trilinkbiotech免疫沉淀產(chǎn)品
3' iCLIP Primer
Cat #: O-30050
| SKU | Unit Size |
|---|---|
| O-30050-03 | 3 nmole |
| O-30050-09 | 3 x 3 nmole |
PO DNA，5'（rApp）AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG（ddC）3'UV交聯(lián)和免疫沉淀（CLIP）的開發(fā)可鑒定RNA-蛋白質(zhì)相互作用（Ule J等，2003）。該方法涉及RNA與蛋白質(zhì)的不可逆交聯(lián)，免疫沉淀，5'和3'銜接子的連接，逆轉(zhuǎn)錄以及后的PCR擴(kuò)增。不幸的是，CLIP受到限制，因為逆轉(zhuǎn)錄酶無法讀取交聯(lián)區(qū)域。這樣就創(chuàng)建了不需要啟動PCR擴(kuò)增所需的3'和5'銜接子的截短的cDNA。雖然存在多種CLIP方法版本，但單個核苷酸分辨率的UV交聯(lián)和免疫沉淀（iCLIP）具有許多優(yōu)勢。iCLIP解決了截短cDNA擴(kuò)增差的問題。這可以通過使用預(yù)腺苷酸化引物（iCLIP引物）和逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的環(huán)化來實現(xiàn)。該方法還解析了與單個核苷酸的結(jié)合位點，并提高了位于重復(fù)基序內(nèi)的結(jié)合位點的準(zhǔn)確性（Konig J et al。2010.，Konig J et al。2011）。
| 貨號 | O-30050 |
|---|---|
| 質(zhì)量控制 | 通過 |
| 骨干 | 磷酸二酯 |
| 序列 | 5（rApp）AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG（ddC）3 |
| 推薦儲存 | -20°C以下 |
| 應(yīng)用 | 下一代測序（NGS） |
